據介紹，衛生部主要采取了以下五種方式對醫藥費用進行控制。

　　第一，設定控費目標，落實控費責任。衛生行政部門采用總量控制、指標限定、目標管理的方式，對公立醫院費用總量、費用構成結構等進行監測，并據此落實控費責任;與醫院簽訂控費工作責任狀，落實控費任務。

　　第二，加強醫院內部管理。各地實施臨床路徑管理，規范醫療行為，控制不必要的診療活動;完善醫療服務信息公示制度，主動接受社會監督。

　　第三，降低醫療服務要素成本。推進和完善集中招標采購制度，降低藥品和醫療器械的采購成本和價格;逐步實行同級醫療機構檢查、檢驗結果互認，減少重復檢查。

　　第四，完善激勵約束機制。探索按病種付費、按人頭付費、總額預付等，促使醫院和醫務人員自覺控制成本;探索醫院內部分配制度改革，強調內部分配要體現多勞多得和優勞優得，更加關注綜合目標、質量和效率。

　　第五，轉變就診模式。調整醫保報銷政策，制定雙向轉診規范，促進基層首診、分級醫療，降低醫藥費用。

　　周軍指出，醫保支付方式改革是醫療費用控費的主要手段。世界上絕大多數國家的通行做法都是通過支付方式來控制醫療費用，主要包括總額預付、按人頭付費、按病種付費等，這種支付方式將藥品、耗材、檢查等作為醫療成本，醫院和醫務人員就會自覺控制和調整，減少不必要的支出。今后，控費是公立醫院改革的一項重要任務。