近日，《Nature Genetics》以“Chromosome-level genomes of three key Allium crops and their trait evolution”為題，發(fā)表了西北工業(yè)大學(xué)生態(tài)環(huán)境學(xué)院蔡晶和王文教授團(tuán)隊聯(lián)合生命學(xué)院楊慧教授、新西蘭奧塔哥大學(xué)生物化學(xué)系Richard Macknight教授和華大農(nóng)業(yè)基因組國家重點實驗室徐訊教授關(guān)于蔥屬植物生物多樣性起源進(jìn)化機(jī)制的研究成果。

　　該研究圍繞具有重要食用和藥用價值的蔥屬植物，從蔥蒜獨特氣味和膨大球莖的角度系統(tǒng)解析了這些重要性狀形成和演化的分子機(jī)制。結(jié)合代謝組和大尺度的進(jìn)化基因組學(xué)分析，構(gòu)建了蔥屬植物特有的蒜氨酸合成代謝通路，發(fā)現(xiàn)該通路起源于基部植物類群中已存在的防御通路。通過高精度時空轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)分析，繪制了參與球莖膨大基因通路的全景圖，提出包括細(xì)胞骨架重排、植物激素調(diào)控、液泡內(nèi)糖代謝與轉(zhuǎn)運等多種基因通路共同作用導(dǎo)致球莖膨大。該成果對未來實現(xiàn)蔥屬作物的分子育種提供了重要基礎(chǔ)，也凸顯了基因組大數(shù)據(jù)在生物多樣性保護(hù)研究與利用中的重要價值。